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《基于网络CRISPR_英亚体育登录
时间:2020-11-11 来源:英亚体育 浏览量 36464 次
本文摘要:然后,研究组用转化生长因子1(TGF1)诱导肠上皮细胞恶性转化,再用一种新的CRISPR-Cas9人类群体(一种基因治疗方法,需要通过DNA切割技术对各种疾病进行化疗)对炎症性癌症转化关键子网中的差异遗传相互作用网络模块进行测试和鉴定。

最近,在国际制备生物学领域的权威期刊《ACS合成生物学》上,清华大学邵丽教授的文章《基于网络CRISPR-Cas9人组辨识人体细胞中的协同机制》作为封面文章发表。研究小组发现,六味地黄丸及其同类方剂中有一些中药成分可以诱导肠炎细胞的恶性转化。鉴于我国消化道恶性肿瘤发病率不断上升,课题组试图从生物分子网络的角度了解炎性癌转化和肿瘤发生的内在机制,有助于解决以往单靶点研究模式的局限性,从系统的角度展开对肿瘤的精准防治,推动肿瘤“清领无病”的研究进展。课题组明确提出了计算预测和实验分析相结合的方法。

网络药理学

这种方法可以找出消化系统炎性癌的转化过程是如何发生并再次进展的。随后,研究组利用CIPHER(一种自主开发的、基于网络的全基因组病原体基因预测方法)对参与炎症和癌症的基因进行预测,融合了消化系统不同部位(胃、肠、肝)和不同阶段(正常人、炎症和癌症患者)的共同基因表达序列数据,测试哪些基因可能影响消化系统炎症性癌症的转化过程,即明显与消化系统炎症性癌症的转化有关。然后,研究组用转化生长因子1(TGF1)诱导肠上皮细胞恶性转化,再用一种新的CRISPR-Cas9人类群体(一种基因治疗方法,需要通过DNA切割技术对各种疾病进行化疗)对炎症性癌症转化关键子网中的差异遗传相互作用网络模块进行测试和鉴定。通过对炎症诱导的差异遗传相互作用网络模块的分析,解释了明显不同基因之间的功能协同特征。

网络药理学

最后,研究组以将炎性癌症转化为关键子网的协同功能模块为干预目标,从早期发现的中药经典方剂六味地黄丸及其同类方剂中,识别出一些需要不同程度干预网络的代谢-免疫系统等协同模块,诱发肠炎细胞恶性转化的中药成分,从而从机理上为解释中药的多成分协同作用获得了新的依据和新途径。研究小组称之为,这项研究创造了一种计算与实验相结合的网络研究方式,用于寻找炎症性癌症转化过程中的调节机制。还预测了可用于将炎性癌症转化为化疗的中药,为理解和解释单纯性疾病的复发过程提供了新思路,也有助于网络药理学研究方法的新进展。据报道,早在2014年,课题组就利用网络药理学和系统生物学的方法,在痈的生物学基础和中药方剂研究方面取得了新的进展。

网络药理学

课题组创造了一套高精度的网络药理学智能算法,在炎性癌症的转化和中药网络调控机制等方面取得了一系列成果,为推动中药“古方新用”探索了一条新途径。

网络药理学


本文关键词:英亚体育登录,中药,课题组,网络药理学

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